A veces, esto podría ser la nomenclatura. Si compara el plan de estudios / plan de estudios de dos de estos cursos, sabrá la diferencia.
En general, temas como la introducción a estructuras de datos, algoritmos, programación, etc. son comunes a ambos programas.
Sin embargo, una Maestría en Ciencias de la Computación puede incluir temas como Teoría de la Computación, Teoría de la Complejidad, temas avanzados en Compiladores y SO que un Máster en TI no necesariamente cubre.
Una maestría en TI puede incluir temas como desarrollo web, desarrollo de aplicaciones móviles, computación en la nube y más.
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¿Cual es mejor? Eso depende de los intereses de uno. Una base sólida en CS central siempre ayuda. Pero algunos pueden no querer profundizar en los aspectos teóricos y están felices de aprender programación y construir / mantener aplicaciones.
Con la automatización asumiendo muchos de los trabajos, siempre es mejor prepararse para trabajos de alta gama en CS. Y para esto es deseable sumergirse profundamente en el núcleo CS.