¿Qué rama es mejor después de un BTech en un CSE para hacer un MTech?

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Su pregunta no aclara si está buscando una rama de ingeniería diferente para su M.Tech o una rama diferente de Ciencias de la Computación para ella.
Si desea cambiar su transmisión de Ciencias de la computación a cualquier otra rama de la ingeniería (Mech., Civil, Electrónica, etc.), entonces mi consejo es que no lo haga, porque sería muy difícil estudiar Maestría en una materia en la que No tienes licenciatura.
Si desea conocer diferentes ramas dentro de la informática, primero debe analizar su área de interés. Puede continuar en Redes (mi favorito), Base de datos, Ingeniería de software, Sistemas operativos, etc.
En el mercado actual, la oportunidad de trabajo es casi la misma en todas las secciones de M. Tech. Mi consejo en esta parte es buscar ayuda en Internet, buscar el alcance futuro de las diferentes ramas de su interés. Busque sobre qué ramas son beneficiosas para estudiar de qué universidades. Relacione los resultados de búsqueda con el tipo de trabajo que desea realizar, desarrolle un resultado general y luego tome su decisión.