¿Cuánto no tener un buen porcentaje en los primeros 2 años de B.Tech disminuye sus posibilidades de tener una maestría en el MIT u otras universidades importantes (todo lo demás se mantiene aparte)?

Las universidades de Ivy League requieren que seas perfecto y, a menudo, no pases por alto ni el más mínimo lugar en tu perfil. No te desanimes si no obtienes una liga Ivy. Hay más en el proceso de selección que solo mérito. Consideran el linaje, etc. Es muy subjetivo y nunca puedes estar seguro de que pasarás. Ven a los académicos correctamente. Además de las universidades de ivy league, hay muchas universidades excelentes que se centran en tus méritos y esfuerzos en el campo que estás persiguiendo. (Por suerte).
Simplemente mantenga su GPA en la mejor parte y trabaje aparte de su curso. Eso debería ser una buena opción para las universidades. Yo mismo lo estoy intentando y estas universidades tienen mucho en su proceso de selección, a diferencia de la India, donde das un examen y, si lo aclaras, estás dentro. Diversidad y mentes innovadoras es lo que buscan las universidades en los Estados Unidos.