Esas preguntas dependen de lo que intentas prototipar. Por ejemplo, recientemente tomé una clase donde todos recibieron instrucciones de hacer una computadora analógica que calcule la trayectoria de una pelota que rebota. La mayoría de la clase primero intentó simular el diseño del circuito y luego replicarlo en la placa de pruebas. Ni una sola persona tenía un circuito de trabajo, incluso el simulador dijo que lo haría. Todos tuvieron que sentarse y rediseñarlo en el tablero, aprendiendo sobre los diversos parámetros del circuito.
En este momento, muchas herramientas de simulación de circuitos macroscópicos son solo eso, una herramienta. Debe tener una comprensión fundamental del circuito y la herramienta que se está utilizando. Hay muchos parámetros del circuito y la física subyacente que deben tenerse en cuenta y no siempre se tienen en cuenta al hacer la simulación.
Agregaré que las herramientas de simulación de circuitos integrados son altamente avanzadas y muy capaces de proporcionar un modelo de simulación preciso. Sin embargo, en primer lugar, no puede realizar pruebas en circuitos integrados. La razón de esto es posible por las estrechas tolerancias del proceso para hacer circuitos integrados. La simulación tiene suficientes conocimientos como para hacer buenas suposiciones sobre la física del problema. Sin embargo, los programas de simulación macroscópica tienen más dificultades con esto ya que hay más factores ambientales.
Además, los circuitos pueden ser difíciles de conectar en algunas situaciones. A medida que aumentan las frecuencias, los efectos de la línea de transmisión comienzan a ocurrir. Los efectos de la línea de transmisión incluyen comportamiento eléctrico extraño y cables que actúan como antenas. Estos efectos generalmente ocurren si una longitud de cable tiene más de 1/10 de longitud en comparación con la longitud de onda de la señal. Además, a medida que los circuitos se vuelven cada vez más rápidos, las longitudes exactas de los cables se vuelven muy importantes para intentar mitigar estos efectos.
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Puede parecer que me he contradicho en esta respuesta, pero no lo he hecho. El diseño de circuitos es una tarea muy complicada que requiere el uso de muchas herramientas. Tener un conocimiento profundo de las limitaciones de estas herramientas le permitirá diseñar y probar el circuito de manera efectiva.