Realmente depende de lo que desee hacer y del nivel de tecnología al que tenga acceso. Suponiendo que tenga acceso a las últimas tecnologías, la respuesta es más simple.
MOSFET es, con mucho, el interruptor más versátil. No hay mucho que BJT pueda hacer que MOSFET no pueda hacer. Sin embargo, no puedes decir lo mismo para BJT. MOSFET es un excelente conmutador analógico especialmente con CMOS. Puede ser conducido por electrónica de baja potencia si la velocidad no es una preocupación. Incluso para el conmutador digital, una tecnología MOSFET de .13u o mejor es bastante capaz de aplicaciones de alta velocidad de hasta unos pocos GHz.
Solo con las aplicaciones de ultra alta velocidad,> 10 GHz, es donde brilla BJT. El hecho es que incluso con el BJT de silicio estándar más avanzado, la velocidad probablemente no sea lo suficientemente alta para aplicaciones de 10 GHz. Para llegar a estas velocidades ultra altas, tenemos que confiar en SiGe HBT u otros semiconductores compuestos y no solo en silicio BJT.
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