Si no tiene publicaciones cuando llegue al quinto año de su doctorado, ¿se encontrará en una situación grave cuando busque un puesto académico después de graduarse?

Creo que hay diferentes resultados.
Si está en su quinto año y no tiene ninguna publicación puede ser para a) su investigación no logró ningún resultado o datos b) fue flojo c) tiene los datos pero está esperando que su supervisor escriba sus documentos d) usted tiene los datos, pero tanto usted como su supervisor planearon que solo publicaría dos documentos impresionantes en revistas de renombre e) ya escribió sus documentos pero su supervisor no terminó de revisarlos o no tiene el tiempo / voluntad de hacerlo

En casi todas esas situaciones estarías en una situación grave después de graduarte, excepto d) y e)

Pero, una vez más, esto puede ser solo aplicable si desea seguir la academia. Si quiere trabajar como empleado de alguna empresa, a veces la cantidad de información que aprendió es más útil que sus publicaciones.

Básicamente, para darle una mejor respuesta, necesitaría dar más detalles.

No necesariamente como yo lo veo. Lo que necesita es al menos UNA publicación al final de su doctorado. Si puede convencer a su posible empleador de que:

a) Sabes cosas que son útiles para su laboratorio.
b) Puedes hacer eso
c) HAS hecho eso

entonces es una buena razón para que estén interesados ​​en ti. La publicación simplemente sirve para ejemplificar su capacidad de … publicar. Lo cual es crucial, por supuesto.