Lo primero que debe comprender es que los diferentes programas universitarios en estos campos son bastante variados en lo que enseñan. He visto programas de ingeniería de software donde la única diferencia con CS es que los ingenieros de software tomaron uno o dos cursos no requeridos por los estudiantes de informática (generalmente algo en diseño de software y algo en administración de software) y otras universidades donde los planes de estudio eran casi enteramente diferente (ingenieros de software que toman muchos cursos que podrían ser optativos para especializaciones en ciencias de la computación, como diseño de interfaz humano-computadora, un curso completo sobre gestión de la configuración (en lugar de algunas conferencias en un curso de CS), cursos sobre ingeniería de calidad de software, métricas de software, análisis y modelado de requisitos de software, uno o dos cursos sobre diseño de software, pruebas de software, etc. Por lo tanto, es muy importante ir al sitio web de una futura universidad y comparar los planes de estudio reales. Un buen ejemplo de programas en los que son muy diferentes sería RIT o SMU o CMU o MSOE, que tienen programas de MS en ambos campos que son bastante diferentes, aunque comparten muchos fundamentos. Revisar programas como estos proporcionaría una buena respuesta a su pregunta.
En teoría, la informática te enseña a ser un investigador de CS y te prepara para un trabajo como investigador o miembro de la facultad de CS (encontrando soluciones innovadoras para problemas informáticos), mientras que la ingeniería de software te enseña a ser un profesional, desarrollando software real para clientes reales: aplicando esas ideas creativas utilizando principios de ingeniería para crear software en el que se pueda confiar y depender. En ese sentido, CS es la ciencia y la ingeniería de software es la ingeniería. Un programa de ingeniería de software que sea fiel a esta distinción tendrá cursos de ingeniería de software desde el principio que difieren significativamente de sus contrapartes de CS. Por ejemplo, enfocarse en hacer diseños resistentes y sostenibles basados en principios de ingeniería en lugar de diseños inteligentes basados en conceptos teóricos interesantes. Esto no quiere decir que los ingenieros de software no aprendan los principios de CS. Los buenos ciertamente lo hacen, así como los buenos ingenieros aprenden ciencia. La verdadera diferencia está en lo que planeas hacer con ese conocimiento: expandirlo (CS) o aplicarlo (SWE).
Desafortunadamente, sin embargo, en la práctica hay mucha confusión entre los dos. Esto se debe a que, aunque la mayoría de los programas están en CS, la mayoría de los trabajos son en realidad en ingeniería de software. Debido a este aspecto inconveniente de la realidad, muchas universidades tienen títulos de maestría en informática que se centran principalmente en temas de ingeniería de software o han agregado títulos de maestría en ingeniería de software que son extensiones de los programas de CS existentes. Solo unas pocas universidades han tomado la ingeniería de software lo suficientemente en serio como para tener programas de CS y SWE que son significativamente diferentes (mencioné algunos de ellos, más arriba).
Por cierto, los empleadores generalmente no distinguen mucho entre los dos porque no entienden la diferencia o se dan cuenta de la confusión que he mencionado anteriormente. Los empleadores que entiendan examinarán de cerca los cursos específicos que alguien tomó y las cosas que lograron durante sus años como estudiante. Desafortunadamente, muchos empleadores no se dan cuenta de que la ingeniería de software es mucho más que programación. Contratan personas por su conocimiento de un lenguaje o enfoque de desarrollo actualmente popular, sin darse cuenta de las limitaciones de su conocimiento. En mi experiencia de contratación de ingenieros de software y especialidades de CS durante casi 40 años, descubrí que aquellos con la educación más sólida tendían a tener mejores carreras a largo plazo. La diferencia comienza a aparecer cuando les das puestos con mayor responsabilidad, donde ya no programan para ganarse la vida, sino que tienen que dirigir, administrar, planificar, etc.
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Le recomiendo que examine algunos de los programas que mencioné, vea cuáles son las diferencias y decida cuál le resulta más atractivo.