Ambas escuelas tienen excelentes programas de CS. Creo que tendrá recursos muy similares y calidad de educación en cualquiera de las universidades.
Si desea ingresar a la tecnología, no puede vencer a Stanford por su proximidad al Silicon Valley (fácil de establecer contactos, escuchar de las principales empresas emergentes y empresas de tecnología, y amplios eventos de reclutamiento de las mejores empresas en el campus). Estoy planeando tomar Machine Learning el próximo otoño impartido por el muy conocido profesor Andrew Ng.
Soy un poco parcial hacia Stanford, pero sé que CMU también está bien conectado con las compañías SV, así que estoy seguro de que hay oportunidades similares allí.
Consideraría con qué profesores quieres trabajar (ya que mencionaste que quieres investigar) y de qué cultura quieres ser parte.
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Stanford tiene un ambiente muy relajado, estudiantes emprendedores, estudiantes humildes (muy raro, encuentro a alguien pretencioso que se jacta de sus logros), un cuerpo estudiantil extremadamente diverso y tiene un clima increíble durante todo el año.