Los problemas del Premio del Milenio son siete. Hay miles de problemas abiertos en matemáticas. Ergo, muchos problemas tuvieron que quedar fuera, incluidos algunos que son profundos, significativos e interesantes.
El problema de la factorización de enteros es un problema de complejidad computacional: encuentre un algoritmo eficiente para factorizar enteros (probablemente imposible), o pruebe que no existe ninguno. Ya existe un Problema del Premio del Milenio sobre la complejidad computacional, y es increíblemente más profundo y de mayor alcance: P vs NP.
La inclusión de otro problema de complejidad en la parte superior de P vs NP habría sido muy sesgada. Los problemas intentan abarcar diversos dominios matemáticos y, por supuesto, con solo siete problemas, se van a omitir campos completos. Elegir dos problemas de un dominio no tiene sentido, e incluir Factorización entera en lugar de P vs NP tiene aún menos sentido.
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