Voy a ampliar mi respuesta para centrarme en la criptología como un todo dado que el lineal tiene grandes aplicaciones en ambos lados del cifrado.
En criptografía (escritura de códigos) usamos lineal en varios sistemas criptográficos geométricos. Por ejemplo, algunos tipos de criptografía de curva elíptica (ECC) incorporan una serie de transformaciones matriciales como parte del descifrado y el cifrado.
En el criptoanálisis (descifrar matemáticamente los códigos) utilizamos sistemas lineales para resolver ecuaciones relacionadas tanto con la gramática como con el lenguaje en texto cifrado y la correspondiente incidencia / probabilidad de dicho lenguaje dado nuestro conocimiento de ese criptosistema.
Este es en realidad un campo completo de criptoanálisis llamado criptoanálisis lineal , llamado así por su uso de álgebra lineal.
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Estoy seguro de que también usarías lineal de alguna otra manera. Por ejemplo, me imagino que usa lineal para probar algunas cosas sobre el tamaño del conjunto de claves potenciales o la probabilidad de que el bruto fuerce algún texto cifrado.